时间来到唐朝末年。宝应二年（763年），安史之乱被镇压后，经历盛世的大唐王朝由盛转衰。一方面，连年旱灾，赋税又重，老百姓生活穷困潦倒；一方面，因为北疆边防问题，和契丹战火不断。导致的结果是阶级矛盾激化、国库虚空。伴随其间的是大大小小的农民起义，其中影响力最大的是黄巢起义，时间为乾符五年至中和四年（878年至884年）。黄巢起义一度打到今日深圳的大鹏古城，并造成了不小的影响。

黄巢，曹州冤句（今山东菏泽）人。他自己不是穷苦农民，而是个有钱的盐贩子。但这个人志向远大、野心勃勃，总想干点儿大事。社会一片哀嚎时，他就带领农民起义，可以说是时势造英雄。当时山东还有一个农民起义首领，名叫王仙芝，他的队伍最大，黄巢就带着自己的人加入了王仙芝的队伍。不过这个王仙芝并不是真正想起义，很快就想和朝廷谈条件，让朝廷给自己官当。黄巢是想起义到底的，于是和王仙芝绝了交，自己继续起义。很多农民觉得还是跟着黄巢有希望，一下子黄巢威信高了，队伍强大了。很快，黄巢起义军先后攻占了开封、信阳、阜阳等地，接着准备攻占洛阳。攻占前，黄巢得知朝廷派了大量军队，准备集中力量歼灭起义军。黄巢走为上策，转到了江南。在南方，起义军一路南下、一路攻打、一路获胜、一路得到老百姓的拥护，最后把岭南占领了。当时，黄巢想在岭南圈地、屯兵，成立自己的政权，但因为官兵大部分是北方人，不习惯南方湿热气候才继续北上。北上之路也很顺利，皇帝唐僖宗吓得都逃离了京城长安。黄巢在长安建立自己的政权“大齐”。然而遗憾的是，这之后的黄巢和他的士兵成了杀人大魔头，可恶至极。“水可载舟，亦可覆舟”，最后，黄巢失去了老百姓的支持，起义以失败告终。

黄巢起义军占领岭南的过程如何呢？乾符六年（879年）春天，起义军经泉州、潼州进入潮州，并在五月攻下了深圳所在的原东莞县，随即又包围了广州城和附近县城。明朝天顺年间编制的《东莞县志》里就有记载：“归城里梅塘村，耆旧相传为黄巢地。”明朝崇祯年间编制的《东莞县志》也有类似记载：“黄巢分兵，掠至归城里梅塘村。”这个“归城里梅塘村”，就是今日深圳的大鹏古城附近。

到了深圳后，黄巢驻扎下来。和当年的王仙芝类似，这时候的他也想让朝廷给个官当。他要的官是天平军节度使。广州节度使替黄巢向朝廷禀报。结果呢，皇帝唐僖宗答应的官职是“率府率”。这个官职名字很古怪，大致可以理解为太子身边众多服务员的主管。这是个很小的官职，自然惹怒了黄巢。他一天时间就把广州城打了下来，还把广州节度使给抓了起来。攻下广州后，起义军先是对语言不通，即对本地人施行武力征服，之后又将矛盾对准了外国商人。这是黄巢起义军永远无法抹去的重大污点。